不确定系统研究所成立于2005年12月, 彭锦教授任研究所所长。本所具有四个特色鲜明的研究方向, 即不确定理论与不确定规划、系统控制与可靠性、智能计算及应用、空间信息处理与应用。每个研究方向均由具有硕士生导师资格的教授或博士作为学术带头人, 力量配备齐全, 梯队层次合理。
研究所研究人员一直共同致力于不确定性理论及其应用方面的有关研究工作, 密切追踪国际、国内最新研究动态, 近五年来取得了一系列高水平的研究成果：在国际期刊、国内权威期刊、核心期刊、国际国内会议上等公开发表学术论文280余篇, 其中SCI、EI、ISTP三大检索论文共90余篇，其中SCI检索14篇，EI检索43篇，ISTP检索37篇；出版了学术著作10部,主编教材6部，主编会议论文集3部；获“钟家庆运筹学奖”1项、湖北省自然科学优秀学术论文奖2项、黄冈市自然科学优秀学术论文奖10项。
研究所共承担了国家自然科学基金项目 、湖北省教育厅自然科学科研重点项目 、湖北省教育厅优秀中青年人才项目 、湖北省科技厅优秀中青年人才国际科技合作与交流项目 、湖北省教育厅科研重大项目 、湖北省高等学校优秀中青年科技创新团队项目 、湖北省自然科学基金项目等20余个项目的研究。
本所先后成功举办了两次全国性学术会议，即“第九届中国青年信息与管理学者大会暨第五届中国不确定系统年会”和“第一届中国智能计算大会”。